5. del 2000 - 2009
I 2000-01 kom den første opmuntring da det med en 2-1 sejr over Korup blev til klubbens sidste oprykning til 1Division. Thomas Rasmussen og Kim Kristensen scorede målene på hjemmebanen på Gillestedvej som opfindsomme sjæle døbte Gillested Park.I 2001-02 reddede klubben sig atter lige over nedrykningsstregen, men kom atter i fare i efterårssæsonen. Det betød et farvel til træneren og goddag til en ny. Jens Letort som havde spillet på niernes ynglingehold i sin tid. Den svære øvelse var ved at blive fuldendt da klubben kom op over stregen inden kampen på Odense Stadion hvor B 1913 i næstsidste runde blev slået 3-2 med 4.589 besøgende. Desværre tabte de røde den sidste kamp mod HFK Sønderjylland og dermed farvel og tak. Så fulgte den sidste store satsning da Tommy Møller Nielsen atter blev træner i B 1909 og en stribe spændende spillere trådte ind på scenen. Det skulle bare ikke være og i 2003 var B 1909 på randen af en ny konkurs. Så kom OB på banen og hjalp B 1909 ud af kniben med et lån af både likvide midler og spilleren Rasmus Johansen. Ellers skete der ikke særligt meget omkring det; men det var ikke alle der tænkte lige gode tanker om handlemåden og OB`s projekt ”Øens hold” med en lang række mindre udviklingsklubber som set fra Ådalen kunne være en kasse at putte den gamle rival i.
B 1909 flyttede i 2004 sine kampe ud på Atletikstadion og ungdomsafdelingen indgik et - skulle det vise sig – fornuftsægteskab (holdfællesskab) med Fjordager og fik hen af vejen fine resultater. Dette skulle holde frem til sommeren 2009.

B 1909`s 2. Divisionshold tullede rundt sammen med B 1913 og Dalum og sidst i 2005 sprang bomben: De tre skulle lave et fælles hold men bevare deres egne 1. hold i Danmarksserien.
FC Fyn blev vedtaget i alle tre klubber. Størst modstand var der i B 1913, mens B 1909 havde klart flertal på ja-siden. Men mange ikke-medlemmer, der altså ikke kunne stemme om forslaget, skumlede.
Forinden skulle turneringen spilles til ende og B 1909 med Johnny Hansen ved trænerroret havde en pokalkvartfinale mod Esbjerg at afvikle.
Tab og vind i pokalen.
finaledeltagelsen i 1977 leveret nogle opsigtsvækkende resultater af forskellig karakter. Men vi skal faktisk helt frem til 1992, før der optræder et resultat af i nærheden af en finalekamp. Semifinalerne mod AGF betød 0-1 i Aarhus og 1-1 i Odense og dermed exit efter et godt run, hvor Brøndby røg ud på straffespark efter en særdeles medrivende kamp. Steen Petterson udlignede til 1-1 efter at målmanden Henrik Jørgensen var blevet smidt ud. Runden efter var turen kommet til Næstved, ligeledes fra Superligaen. Her blev resultatet 2-1 efter endnu en hylende kold novemberaften, hvor man mildt sagt frøs med anstand.
I 1993 kom mesterholdet FCK til Odense hvor et amputeret B 1909 hold sensationelt vandt 3-0. Året efter måtte B 1909 som DShold igennem den fynske kvalifikation med programmerede storsejre over fine hold som Aasum, 1. FC Nyborg, ØB og Od. KFUM på sammenlagt 26-1 for så endelig at ryge ud i 1. runde til Hammerum fra de jyske serier. Siden var der langt mellem de ”store hold”, men B 1909 spillede en god kamp mod Lyngby (1-3) i 1997 og i 2000 kom OB op af hatten til de to klubbers absolutte sidste topkamp. Selvom det var B 1909`s hjemmekamp blev kampen arrangeret i fællesskab med fælles program og det hele og OB vandt for resten 3-0 efter en mandfolkeindsats af de røde. I marts 2006 spillede B 1909 så sin sidste kvartfinale inde på Odense Stadion. Esbjerg scorede hurtigt og vandt 3-1 i sidste ende. En af B 1909`s finurlige amerikanske spillere, Joe Zewe scorede det enlige mål. Globaliseringen var nået til klubben. Stjernestunderne inde på Atletikstadion i runderne forinden i glimt med målmand Thomas Mikkelsens straffesparksredninger, en enlig svale fra Bakary Bojang og en sejr over B 1913 står dog tilbage i erindringen.
Den allersidste dans i 2006.
I B 1909 havde man desværre ikke taget højde for en underlig regel om at en klub der rykkede direkte ud af 2. Division ikke kunne bruge kontraktspillere fra et overbygningshold og dermed røg muligheden for at B 1909 skulle være andethold for FC Fyn. Til gengæld skulle hele FC Fynmolevitten flytte ind på Gillestedvej. B 1909 lukkede og slukkede for divisionsfodbold i Hjørring i en kamp der endte 3-3. Det var supporternes darling Danny Martin der scorede det sidste mål. DBU havde med vanlig sans for at skabe forvirring indført en kvalifikationsturnering til først 2. Division og siden Danmarksserien med halvårlige turneringer som kun folk med akademiske evner helt forstod og den største skandale der indtraf, var at Superligaklubbernes andethold fik adgang til 2. Division. Her vidste ”de små” klubber aldrig hvad de kom op imod og groft sagt var det konkurrenceforvridende. B 1909 `s Danmarksseriehold klarede sig ganske godt med lidt svingende resultater undervejs med træner Carsten Hemmingsen, der styrede det i 2006-07 sammen med Kent Gregersen og derpå var eneste cheftræner. I året 2008 tog B 1909 hul på fremtiden da kunstgræsbanen blev indviet. Her kan alle klubbens hold boltre sig i spillet der har kendetegnet klubben i 100 år på godt og ondt.